بدأت مکتبة الکوثر نشاطاتها عام 1994 حيث تري رسالتها توفير المصادر العلمية والتعليمية اللازمة لتحقيق أهداف الجامعة العلمية والبحثية.
تضم المکتبة بين جنباتها قرابة 50078 عنوانا بلغتي الفارسية والعربية، و5351 عنوانا باللغة الإنجليزية. کما أنها تحتوي على نحو 2360 رسالة علمية – ماجستير ودکتوراه.
تتکون المکتبة من الأقسام التالية: قسم الرسالات العلمية، قسم المصادر، قسم الإعارة، قسم الدوريات، قسم الإجراءات الفنية.